PCR試劑盒純化所得的DNA,是進(jìn)行分子生物學(xué)研究的寶貴材料。而DNA雜交技術(shù),則能進(jìn)一步揭示DNA分子間的相互關(guān)系,在基因檢測(cè)、遺傳分析等領(lǐng)域意義重大。以下是基于PCR試劑盒純化所得DNA的雜交操作指導(dǎo)。
一、準(zhǔn)備工作
1.試劑與材料準(zhǔn)備:準(zhǔn)備好所需的雜交緩沖液、探針。雜交緩沖液需根據(jù)實(shí)驗(yàn)具體要求選擇合適的配方,其主要作用是維持雜交反應(yīng)的合適環(huán)境,包括合適的酸堿度、離子強(qiáng)度等。探針是一段帶有標(biāo)記的已知DNA序列,用于特異性地與目標(biāo)DNA雜交。同時(shí),準(zhǔn)備好用于固定DNA的硝酸纖維素膜或尼龍膜等固相支持物,以及用于洗滌膜的洗滌緩沖液等。
2.DNA變性處理:將PCR試劑盒純化所得的DNA進(jìn)行變性處理。通常采用加熱法,將DNA溶液加熱至95-100℃,維持?jǐn)?shù)分鐘,使雙鏈DNA解開(kāi)成為單鏈。這一步是雜交的前提,只有單鏈DNA才能與探針進(jìn)行互補(bǔ)配對(duì)。變性后的DNA應(yīng)迅速置于冰上冷卻,以防止其重新復(fù)性。
二、雜交過(guò)程
1.DNA固定到固相支持物:采用點(diǎn)樣或印跡等方法,將變性后的單鏈DNA固定到硝酸纖維素膜或尼龍膜上。點(diǎn)樣法操作簡(jiǎn)單,使用移液器將適量的DNA溶液直接點(diǎn)在膜上;印跡法則常用于將凝膠電泳分離后的DNA轉(zhuǎn)移到膜上。固定過(guò)程可通過(guò)烘烤或紫外線照射等方式實(shí)現(xiàn),目的是使DNA牢固地結(jié)合在膜上,以便后續(xù)雜交反應(yīng)的進(jìn)行。
2.預(yù)雜交:將固定有DNA的膜放入含有預(yù)雜交液的雜交管或雜交袋中,在一定溫度下孵育一段時(shí)間,一般為1-2小時(shí)。預(yù)雜交液中含有封閉劑,如鮭魚(yú)精DNA等,其作用是封閉膜上非特異性結(jié)合位點(diǎn),減少后續(xù)雜交過(guò)程中的非特異性雜交信號(hào)。
3.雜交:倒掉預(yù)雜交液,加入含有探針的雜交液。雜交液的溫度需根據(jù)探針的類型和長(zhǎng)度進(jìn)行優(yōu)化,一般在42-65℃之間。在雜交過(guò)程中,探針會(huì)與膜上互補(bǔ)的DNA序列進(jìn)行特異性結(jié)合。雜交時(shí)間通常為數(shù)小時(shí)至過(guò)夜,以確保探針與目標(biāo)DNA充分雜交。
三、洗滌與檢測(cè)
1.洗滌:雜交結(jié)束后,需用洗滌緩沖液對(duì)膜進(jìn)行洗滌,以去除未雜交的探針和其他雜質(zhì)。洗滌過(guò)程要嚴(yán)格控制溫度、時(shí)間和洗滌緩沖液的濃度。一般先進(jìn)行低嚴(yán)謹(jǐn)度洗滌,即在較低溫度和較高鹽濃度的洗滌緩沖液中洗滌,去除大部分非特異性結(jié)合的探針;然后進(jìn)行高嚴(yán)謹(jǐn)度洗滌,在較高溫度和較低鹽濃度的洗滌緩沖液中洗滌,進(jìn)一步去除與目標(biāo)DNA結(jié)合不緊密的探針,提高雜交信號(hào)的特異性。
2.檢測(cè):根據(jù)探針的標(biāo)記類型選擇相應(yīng)的檢測(cè)方法。若為放射性標(biāo)記探針,可通過(guò)放射自顯影技術(shù)檢測(cè);若為熒光標(biāo)記探針,則可使用熒光成像系統(tǒng)進(jìn)行檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果以雜交信號(hào)的強(qiáng)弱和位置來(lái)反映,從而確定目標(biāo)DNA的存在和相對(duì)含量。
在進(jìn)行PCR試劑盒純化所得DNA的雜交操作時(shí),每一步都需嚴(yán)格按照操作規(guī)程進(jìn)行,以確保獲得準(zhǔn)確、可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。